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广州市城乡建设网站,腾冲住房和城乡建设局门户网站,做外贸a货网站,建设工程价款结算暂行办法联合物种分布模型在群落生态学中突破了传统物种分布模型的局限#xff0c;能够同时整合环境变量、物种性状、系统发育关系和时空结构#xff0c;为理解物种装配机制提供了全新框架。其中#xff0c;由芬兰Ovaskainen团队开发的HMSC模型尤为突出#xff0c;作为一个基于贝叶…联合物种分布模型在群落生态学中突破了传统物种分布模型的局限能够同时整合环境变量、物种性状、系统发育关系和时空结构为理解物种装配机制提供了全新框架。其中由芬兰Ovaskainen团队开发的HMSC模型尤为突出作为一个基于贝叶斯推断的多变量分层广义线性混合模型它不仅能处理单物种分析更能从群落整体视角揭示生态位分化、种间互作及扩散限制等关键生态过程。本系列专题将从基础到前沿系统介绍HMSC的理论基础、操作流程与实际应用。我们将从R语言入门开始逐步深入到群落生态学假说、贝叶斯统计原理、单物种与多物种建模技术并通过丰富案例展示HMSC在性状‑环境关联、零膨胀计数数据、空间自相关及时间序列分析中的强大功能。专题一 R/Rstudio简介及入门1.R及Rstudio介绍背景、软件及程序包安装、基本设置等2.R语言基本操作包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等3.R语言数据文件读取、整理清洗、结果存储等含tidverse4.R语言基础绘图含ggplot基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储专题二 群落生态学及数据统计分析概述1.群落生态学发展和研究趋势简介2.群落形成机制及物种装配规则Species Assemble Rules3.群落生态数据类型、特点及准备4.群落生态数据与群落生态学主要科学问题关联专题三 联合物种分布模型HMSC及群落数据贝叶斯统计1.联合物种分布模型HMSC贝叶斯统计简介2.联合物种分布模型HMSC参数估计MCMC3.联合物种分布模型HMSC参数及对应群落生态假说专题四 单物种物种水平/单变量HMSC贝叶斯统计1.HMSC程序包基本语法、参数选择、固定效应和随机效应设置、模型诊断等2.HMSC单变量贝叶斯估计VS单变量brms包贝叶斯估计异同3.HMSC物种属性数据单变量贝叶斯估计案例4.HMSC物种有无01数据单变量贝叶斯估计案例5.HMSC计数数据多度单变量贝叶斯估计案例泊松分布、过度离散、零膨胀等6.HMSC混合效应模型固定效应混合效应空间自相关专题五 多物种群落水平HMSC贝叶斯统计模型1.HMSC多物种群落水平贝叶斯统计模型构建介绍2.HMSC低维多物种联合分布模型构建模型构建、物种分布设置解释变量引入环境筛物种关联关系确定生物筛模型诊断及性能评估3.HMSC高维多物种联合分布模型构建模型构建、物种分布设置物种性状、系统发育信息及环境变量引入模型诊断及性能评估模型调整先验分布、解释变量等、拟合和重评估结果展示包括参数热图、种间关联、变差分解Variation Partitioning及排序潜变量等专题六 HMSC包群落生态数据分析高阶应用经典案例1.HMSC包开展群落数据联合物种分布模型分析通用流程Pipelines2.HMSC分析物种属性与环境关系案例3.HMSC分析响应变量为不同分布类型案例4.HMSC空间数据分析案例5.HMSC时间数据分析案例6.HMSC模型中环境变量、物种属性、系统发育、数据分层设置综合案例★ 点 击 下 方 关 注获取海量教程和资源↓↓↓